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Titres et travaux
scientifiques
de
Bodo,
Bernard.
Laboratoire de chimie
appliquée au corps organisé
Paris 1986.
Les êtres vivants, en
particulier ceux du règne végétal, biosynthétisent une grande variété
de molécules organiques, les substances naturelles. Plus fascinant encore, que la
variation de leur structure ou de leur voie de biosynthèse, est leur rôle biologique,
bien que souvent il demeure encore inconnu.
En effet, certaines de ces
substances interviennent dans les interactions entre l'organisme qui
les produit et son environnement. Elles sont alors soit des messagers chimiques, soit
des armes offensives ou défensives. Leur activité biologique conduit parfois à des
utilisations spectaculaires (pénicilline).
Enfin, si les unes ont une large
répartition, d'autres sont caractéristiques d'une espèce et peuvent aider à la
détermination.
La chimie des substances
naturelles recouvre des aspects souvent complémentaires: - Isolement -
Etablissement des structures - Etude des voies de biosynthèse - Synthèse
chimique. Ce sont des étapes préalables à la compréhension de leurs fonctions
biologiques.
Mes travaux ont concerné la
chimie des produits naturels sous ces différents aspects. Eugène CHEVREUL
définissait la chimie comme la science de l'analyse et de la synthèse et
précisait que l'analyse généralement précède la synthèse. Cependant, dans
cet exposé, je présenterai les travaux de synthèse organique avant ceux
d'analyse parce qu'ils ont été effectués chronologiquement dans cet ordre, qui est
pédagogique.
Sous la direction du Professeur
Charles MENTZER, puis celle du Professeur Darius MOLHO, au Laboratoire de Chimie
du Muséum, j'ai abordé la synthèse de substances naturelles. Le but en était,
soit d'obtenir des produits d'intérêt biologique difficiles à extraire, soit
de mieux comprendre les réactions chimiques permettant de transformer
entre eux des composés dont les structures sont reliées.
C'est dans cet esprit que,
intégré dans une équipe de chimistes, j'ai participé à la synthèse de
sels de benzopyrylium et d'analogues ainsi qu'à l'étude de leur réactivité
vis-à-vis de différents agents nucléophiles et de réactifs d'oxydation et de réduction. Le
noyau benzopyrylium intervient dans la structure de composés naturels comme
les anthocyanes. Des oxydations et des réductions appropriées des cations
flavyliums (phényl-2 benzopyryliums) conduisent respectivement aux flavones et
flavènes correspondants. Par différentes méthodes nous avons réalisé la synthèse de
composés naturels ou celle du squelette de produits naturels de la classe des
flavonoïdes.
La charge positive des sels de
flavylium est délocalisée sur les atomes de carbone en position -2 et en position
-4 impliquant de ce fait une réactivité des agents nucléophiles sur l'un ou l'autre
de ces atomes. Nous avons mis en évidence l'influence de la nature du substituant
en -3 sur l'orientation de la réaction avec les alcools et les réducteurs: les
résultats obtenus avec les alcools permettent de prévoir le comportement
vis-à-vis de l'oxydation chromique en flavone : ceux qui réagissent en
-4 peuvent être oxydés en flavone. Le trinitrate de thallium est un agent
d'oxydation utilisable pour réaliser cette même oxydation avec les sels réagissant en
-2 avec les alcools. Certaines réactions observées entre les sels de benzopyrylium
et les alcools ou les cétones ont été généralisées à d'autres ions carbéniums où
la charge est stabilisée par une double liaison: ces ions avaient été formés
par action d'un acide fort sur des diaryl-carbinols substitués.
Une autre partie de mes travaux
de recherche concerne la chimie des substances naturelles sous l'angle
analytique. Nous avons isolé de lichens et de champignons un certain nombre de
substances originales dont nous avons déterminé les structures en utilisant
les méthodes d'analyse spectrométrique et des modifications chimiques.
Le rôle biologique des
substances lichéniques est encore mystérieux, mais leur utilité pour la
détermination et la définition des espèces botaniques est précieuse. Les principales
substances qu'ils produisent et qui les caractérisent sont les depsides et les
depsidones. substances aromatiques. Nous avons isolé et identifié plusieurs
métabolites nouveaux de ce type. Nous avons également extrait et caractérisé
l'acide bourgéanique de plusieurs Ramalina : c'est le seul "depside aliphatique"
des lichens. Sa structure a été élucidée par spectrométrie de masse, de RMN et des
réactions chimiques, puis confirmée par la synthèse. La chiralité des huit centres
d'asymétrie a été déterminée par des méthodes physico-chimiques et vérifiée par
une étude radiocristallographique. Enfin, nous avons montré que l'acide bourgéanique
est biosynthétisé par la voie acétique-polymalonique, donc comme les autres
depsides, et que les nombreuses ramifications méthyles proviennent de méthylations
par la méthionine.
Plusieurs acides aliphatiques nouveaux,
issus d'une biosynthèse mixte utilisant la voie acétique-polymalonique et le cycle des
acides tricarboxyliques ont été isolés de lichens: acides neuropogolique, isomuronique
et w-acétoxy-lichestérinique. Nous avons montré que l'acide
spiculisporique, métabolite de la même classe, produit par un Penicillium
biosynthétisé par condensation d'une molécule d'acide laurique issue de la
voie acétique-polymalonique avec une molécule d'acide a-cétoglutarique provenant du cycle de Krebs.
L'étude des constituants
chimiques des carpophores de champignons collectés en Guyane qui interviennent
dans les processus de décomposition du bois a conduit à l'isolement des acides
ganodériques M et N, nouveaux triterpènes cytotoxiques dérivés du lanostane et
qui présentent un degré d'oxydation élevé, de deux nouveaux stérols et d'une
naphtyl-napthoquinone apparentée à la juglone, l'hypoxylone.
Le développement de ces travaux
d'isolement et d'analyse structurale de produits naturels nous a conduit à
rechercher plus particulièrement les substances qui sont impliquées dans les
interactions entre un champignon et un autre .organisme vivant du règne végétal.
Deux axes sont actuellement suivis: l'un concerne la recherche de substances
émises par des champignons du genre Trichoderma qui
interviennent dans leur action antagoniste contre d'autres champignons (en
choisissant comme cible des phytopathogènes). L'autre concerne la recherche de
phytotoxines émises par un champignon (Hypoxylon mammatum) agent du
chancre des peupliers trembles.
Pour expliquer le pouvoir
pathogène de H. mammatum sur les peupliers trembles plusieurs
phytopathologistes avaient émis l'hypothèse de l'implication de toxines
spécifiques et avaient mis au point des tests d'activité toxique in vitro représentatifs
de la maladie. Nous avons entrepris, en étroite collaboration avec des phytopathogistes
et des forestiers et avec l'appui du CNRS (ATP Messagers chimiques), la
recherche de ces toxines. Nous avons actuellement isolé plusieurs phytotoxines et
déterminé les structures des deux principales, les hymatoxines A et B qui sont des
diterpènes comportant une fonction sulfate. Ces produits sont utilisés par les
phytopathologistes pour étudier la sensibilité des différents clones de tremble aux toxines
dans le but d'essayer d'obtenir une méthode de sélection rapide de clones
résistants et d'étudier le rôle des toxines dans la pathogénéité.
L'action antagoniste des Trichoderma
(champignons saprophytes, très répandus, qui ont un rôle biologique essentiel dans
l'équilibre des sols) contre ' d'autres microorganismes est explicable en partie par la
production de substances antibiotiques-antifongiques. Nous avons caractérisé dans
plusieurs espèces des substances ayant ces propriétés.
Une partie de ces recherches a
été initiée par une collaboration avec la société ORSAN qui souhaitait comprendre
les raisons de l'activité antagoniste remarquable d'une souche de T.
harzianum dont elle avait mis au point la production industrielle.
Nous avons expliqué l'action observée par la production d'une lactone (pentyl-6
pyrone-2) dont nous avons mis en évidence l'activité antifongique et de peptides
originaux, les trichorzianines.
Les trichorzianines sont des
peptides linéaires que nous avons extraits d'une culture sporulée de T.
harzianum et dont les structures sont caractérisées par: - un poids
moléculaire de 1900-2000 dallons, - la présence de 18 amino-acides, la plupart
hydrophobes avec une forte teneur en méthylalanine, - un résidu amino-acide
N-terminal acétyle et un amino-alcool comme résidu C-terminal (Trpol ,ou Phéol). Ces
peptides forment un mélange microhétérogène particulièrement complexe: nous
avons isolé par chromatographie liquide haute performance plus de quinze
constituants se répartissant en deux groupes, les trichorzianines A neutres et les
trichorzianines B acides.
Les séquences des 13 principales
trichorzianines A et B ont été déterminées par l'utilisation complémentaire de la
spectrométrie de masse FAB et de la RMN 2D à haut champ, les méthodes classiques
d'analyse des protéines n'étant pas applicables à ces peptides. L'étude de
leur conformation en solution a été entreprise par RMN et dichroïsme circulaire
et conclut à l'organisation en hélice droite. principalement de type 310
L'hydrophobicité des
trichorzianines suggère une interaction avec les membranes. Aussi nous avons
entrepris l'étude de cette interaction, principalement par les
techniques de fluorescence et observé non seulement une insertion des peptides dans
des bicouches de phospholipides organisés en vésicules, mais encore une
modification de la perméabilité de cette bicouche provoquée par l'addition des peptides.
Profitant de la diversité naturelle des trichorzianines nous avons commencé une
étude de relation structure-activité et observé une variation parallèle de
leur activité sur des modèles de membranes (lyposomes) et des cellules vivantes
(amibes).
Le développement de ces
recherches aura pour but de préciser cette relation structure-activité
et de déterminer la nature des modifications membranaires. Il est soutenu par une
action du CNRS (Interface Chimie-Biologie) dans le cadre d'une collaboration
avec des biologistes et des biophysiciens.
En dehors de ces travaux qui
concernent la chimie des cryptogames, nous apportons notre soutien scientifique à
d'autres recherches sur des substances naturelles impliquées dans des
activités biologiques ou posant des problèmes particuliers et qui font appel
aux mêmes méthodes physicochimiques d'analyse.
Ainsi en collaboration avec des
chercheurs de l'Université de Yaoundé, nous étudions des constituants de plantes
médicinales du Cameroun et avec un chercheur de l'Institut agronomique de
Rabat, nous avons identifié les principales toxines d'une Ombellifère. Une étude
sur les compositions chimiques de cires de cochenille a été effectuée à la demande
d'entomologistes du Muséum National d'Histoire Naturelle.
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